Идея создания Арт-центра имени Марка Ротко родилась в 2002 году и символически стала исходной точкой на пути к возвращению в родной город знаменитого художника, абстрактного экспрессиониста Марка Ротко. Отмечая столетие художника, его дети, Кейт Ротко Призел и Кристофер Ротко, подарили городу сорок ретроспективных репродукций музейного качества, которые стали основой коллекции будущего арт – центра. В 2005 году в Даугавпилсе был проведён первый международный пленер живописи «Марк Ротко», который стал традицией и стабильной основой для дальнейшего пополнения коллекции. Идея пленера предусматривала дарение по меньшей мере двух новых произведений искусства будущему арт- центру. В 2013 году в коллекции Центра Ротко было уже более двухсот произведений живописи, созданных во время пленаров. В настоящее время они формируют «Золотый фонд» коллекции, свидетельствуя о том, что, казалось бы утопическая идея, увенчалась успешной реализацией.

Арт-центр имени Марка Ротко уже идейно был позиционирован как точка мультикультурного диалога, где прошлое в архитектурных формах встречается с творческим импульсом будущего. Активная программа международных симпозиумов и художественных выставок центра способствует привлечению профессиональных представителей современного искусства Латвии и мира и художественному творчеству. Ежегодно коллекцию арт-центра пополняют дарения участников международных симпозиумов в различных художественных техниках (живопись, графика, керамика, фотография, скульптура, текстиль), расширяя географические границы коллекции и подтверждая разнообразие художественного проявления, индивидуальность и даже эксперименты. Индивидуальные дарения художников – это подтверждение успешного сотрудничества в реализации проектов выставок и засвидетельствование почтения Марку Ротко, чья личность пронизывает пространство и сущность арт-центра.

Столь же важное значение в создании коллекции центра имеет сохранение мемориальных ценностей и обеспечение преемственности в искусстве. Поэтому арт-центр сознательно создает мемориальные коллекции родившихся в Даугавпилсе художников (Петериса Мартинсона, Сигурда Видзирксте, Силвы Линарте), сохраняя и рассказывая на языке искусства о личностях и оставленном ими творческом наследии.

В конце 2018 года Центр Ротко заключил договор с художником и меценатом Базилом Алькацци (Basil Alkаzzi) о создании Фонда Basil Alkаzzi, который дал возможность пополнить коллекцию центра высококачественными работами молодых и опытных лавийских и иностранных художников и графиков. Благодаря Фонду коллекция была пополнена работами уже представленных художников (Сигита Даугуле, Сандра Крастиня, Винета Каулача, Анита Мелдере, Гуна Миллерсоне), а также обогащена картинами старых мастеров (Инта Целминя, Эдвард Грубе, Джемма Скулме, Освалд Звейсалниекс) и молодых многообещающих художников (Сандра Стреле, Метра Штелмахере). В коллекцию попали как картины всемирно известных земляков (Сигурд Видзирксте, Жак Шапиро), так и работы региональных художников (Валда Межбарде, Агра Ритиня, Ингуна Лиепа, Илзе Гриезане и др.).